从生物学的角度来看，一个孩子的生物学父亲只能是其中一个男性，而不可能同时拥有两个生物学上的父亲。这是因为人类的生殖过程是基于精子与卵子的结合，而一个受精卵只能由一个精子和一个卵子结合而成。
受精的基本原理
女性的卵子在排卵后进入输卵管，等待与精子结合。精子进入女性生殖道后，会通过竞争进入卵子，而最终只有一个精子能够成功与卵子结合，形成受精卵。这意味着即使女性在短时间内与多个男性发生性行为，也只有其中一个男性的精子会最终成功受精，成为孩子的生物学父亲。
孩子的父亲如何确定？
如果一个女性在短时间内与两个男性有性接触，并且怀孕了，那么要确定孩子的生物学父亲，最可靠的方法是 DNA 亲子鉴定。DNA 亲子鉴定的准确率极高，可以清楚地辨别孩子的父亲是谁。这种检测通常是通过以下方式进行的：
采集 DNA 样本：通常是通过口腔拭子或血液样本，从孩子和两个疑似父亲身上采集 DNA。
分析 DNA 序列：科学家会比对孩子的 DNA 和两名男性的 DNA，看谁的遗传信息与孩子的匹配度更高。
确定生物学父亲：DNA 亲子鉴定的准确率通常超过 99.99%，可以清晰地确认孩子的生物学父亲。
父系遗传特征的观察
有些人可能会想通过观察孩子的外貌特征来判断父亲，但这种方法并不可靠。虽然孩子的长相、肤色、眼睛颜色等特征可能会遗传自父母，但由于基因的复杂性，有时候孩子的外貌可能与父母并不完全相似。因此，单凭外貌很难准确判断谁是生物学父亲。
特殊情况下的基因混合
在极其罕见的情况下，世界上确实存在“双亲遗传”或“嵌合体”现象，例如：
超受精（Superfecundation）：如果女性在短时间内排出多个卵子，并且与不同的男性发生关系，那么这两个卵子可能分别被不同男性的精子受精，导致她在同一次怀孕中生出不同父亲的双胞胎（异卵双胞胎）。这种情况虽然罕见，但在现实中确实发生过。
基因嵌合体（Chimera）：极其罕见的情况下，一个人可能拥有两套 DNA，例如，早期胚胎发育时两个受精卵融合成一个个体。但这种情况并不会导致孩子拥有两个生物学父亲，而只是遗传上的异常。
如果一个女性在短时间内与两名男性有关系并怀孕，那么孩子的生物学父亲只能是其中一位男性，而不是两者共同的。最可靠的方式是通过 DNA 亲子鉴定来确定生父。如果是异卵双胞胎的情况，那么两个孩子可能分别属于不同的生物学父亲，但每个孩子依然只会有一个生父。
如果你有类似的困扰，建议寻求专业的医学咨询或进行亲子鉴定，以获得科学和准确的答案。